Eu-LISA sāka darboties 2012. gada decembrī. Tā nodrošina SIS, VIS un Eurodac darbības pārvaldību. Šī aģentūra pašlaik arī izstrādā jaunas IT sistēmas, kuru mērķis ir uzlabot robežu pārvaldību un iekšējo drošību visā Eiropā. Tās pamatuzdevums ir nodrošināt šo sistēmu darbību 24 stundas diennaktī un septiņas dienas nedēļā.