Agentura eu-LISA (Agentura Evropské unie pro provozní řízení rozsáhlých informačních systémů) zahájila svou činnost v prosinci 2012. Zajišťuje provozní řízení systémů SIS, VIS a Eurodac. Agentura v současné době rovněž vyvíjí další informační systémy, jež zdokonalí správu hranic a vnitřní bezpečnost v celé Evropě. Hlavním operačním úkolem je zajistit, aby tyto systémy byly funkční 24 hodin denně a sedm dní v týdnu.