Igal valikumenetlusel on oma valikukomisjon, kes vastutab selle eest, et konkursiteates kindlaks määratud kvalifikatsiooni ja oskuste alusel valitakse välja parimad kandidaadid. Valikukomisjon koosneb ELi institutsioonide ametnikest. EPSO tagab, et sugude, keelteoskuse, töötajate ja juhtkonna tasandi esindajate ning institutsioonide suuruse suhe oleks valikukomisjonis tasakaalus. Valikukomisjoni tööd juhib esimees, keda abistab vähemalt üks aseesimees. Hindamisel tuleb järgida rangeid konfidentsiaalsusnõudeid.

Kogu valikumenetluse aluseks on erapooletuse põhimõte. Valikukomisjoni liikme ja hinnatava kandidaadi vahel ei või olla otsest hierarhilist ega perekondlikku suhet. Nii valikukomisjoni liikmed kui ka kandidaadid peavad teada andma mis tahes võimalikust huvide konfliktist, nii et oleks võimalik võtta asjakohaseid meetmeid.

Valikukomisjon järgib järjepideval ja läbipaistval viisil konkursiteates eelnevalt kindlaks määratud osalemistingimuste täitmise, valiku- ja hindamiskriteeriume. Ühtlustatud hindamine on tagatud komisjoniliikmete koolitamise, juhendamise ja järelevalve ning nende tegevusele korrapärase hinnangu andmisega.

Võimaliku erapoolikuse avastamiseks ja selle välistamiseks teeb EPSO ka süstemaatilisi kvaliteedikontrolle ja statistilisi analüüse.

Võrdsete võimaluste tagamiseks analüüsib EPSO teste ja katseid ning hindamismeetodeid. Sellega kindlustatakse, et kõiki kandidaate koheldakse võrdselt ja et menetlused on kooskõlas rahvusvaheliste standarditega, sealhulgas ISO hindamismenetluste standardi ja ÜRO puuetega inimeste õiguste konventsiooniga. Samuti püüab EPSO tagada konkurssidel osalejate ja need edukalt läbinud kandidaatide soolise tasakaalu.