Įgūdžių sistemoje apibrėžiami įgūdžiai, kuriuos EPSO aptarnaujamos ES institucijos ir įstaigos laiko būtinais norint veiksmingai dirbti bet kurioje darbo vietoje. Kai kuriuos iš šių įgūdžių atrankos etape vertina EPSO, kitus – pačios ES institucijos ir įstaigos įdarbinimo etape. 

Toliau pateikiami bendrieji įgūdžiai ir atitinkami jų pagrindai.