Euroopan innovaationeuvoston ja pk-yritysasioiden toimeenpanovirasto (EISMEA) vastaa Euroopan innovaationeuvoston (EIC) kehittämisestä ja toteuttamisesta riippumattoman johtokunnan ohjauksessa ja ottaen huomioon EIC-rahaston kautta tehtävät sijoitukset. EISMEA hallinnoi myös muita EU:n ohjelmia, joista tuetaan pk-yrityksiä, innovoinnin ekosysteemejä, sisämarkkinoiden kehittämistä, kuluttajapolitiikkaa ja alueiden välisiä innovointi-investointeja.